Phân gà bón rau thì tốt rồi vì hàm lượng chất dinh dưỡng cao, tuy nhiên vẫn phải để ý cân bằng dinh dưỡng đất nếu bón phân gà trong thời gian dài. Riêng phân chó, mèo, lợn thì dù ủ hoai thì khi trồng rau "sạch" người ta cũng không cho phép vì vẫn tồn tại một số khuẩn có thể gây bệnh cho người.
Việc trộn vôi vào phân cũng không hoàn toàn sai nhưng dùng cho trường hợp bón phân thô theo cách làm cũ để trung hòa acid hữu cơ làm chua đất, hay khi bón phân chuồng ủ hoai trong thời gian dài. Việc bón phân thô, tươi hay đã ủ hoai còn tùy thuộc vào nhiều yếu tố. Tuy nhiên phân đã ủ hoai thì cách sử dụng dễ hơn, kiểm soát dễ hơn, an toàn hơn vì quá trình ủ (yếm khí, nhiệt độ cao) có thể tiêu diệt vi khuẩn. Ở những vùng hay có mưa lớn còn cần cân nhắc đến cách bón phân, cách phủ mặt đất sau vụ thu hoạch vì rất dễ gây ô nhiễm môi trường nước.
Đại khái lý thuyết em tìm hiểu trên đây qua sách, báo. Mong các bác/chú/anh có kinh nghiệm góp ý để hoàn thiện hơn với em ạ.